北京海關目前共有關員和緝私警察一千余人，業務管轄范圍是北京市（包括市區和所有郊區縣）。負責對北京地區進出境運輸工具、貨物、旅客行李物品和郵遞物品的監督管理，征收關稅和其他稅費，查緝走私，編制海關統計。
在貨運監管方面，北京海關以首都機場、京津塘高速公路和北京鐵路樞紐為依托，建立了空運、海運、陸運監管通道。年監管貨物140多萬噸，集裝箱2萬多箱。近年積極向國際慣例靠攏，改革通關制度，先后推出 H883自動化報關、口岸直通式監管模式、EDI快件及普貨通關系統，開通與16家大型企業的無紙報關聯網等一系列改革措施，大大提高了通關效率。
在旅客行李物品監管方面，為適應進出境旅客逐年大幅度遞增的形勢要求，保證在旅檢工作中監管與方便相統一，北京海關從80年代中期即開始在空運旅檢工作中實行了《京都公約》F3附約中規定的紅、綠通道制度，從而大大地加快了旅客通關速度，給進出境旅客提供了便利。近年年驗放進出境旅客一直保持在500萬人次以上。
北京海關郵遞物品監管量居全國海關首位，年驗放郵遞物品近4000萬件，進出境印刷品3600余萬件。1995年郵檢自動化系統正式啟用，結束了北京海關郵遞物品監管手工操作的歷史，使郵檢工作達到全國領先水平。
在稅收征管上，北京海關堅持依率計征，依法治稅，現場征稅與事后重點稽查相結合。改革開放以來，稅收年均遞增39.7%，從1999年開始，年稅收超過100億元。
近年來，加工貿易監管合同備案數以每年20%遞增，年備案合同達5000余份，逐步形成了多層次、多領域的保稅業務監管體系。99年在北京海關備案的加工貿易企業有800多家，寄售維修保稅倉庫和其它備料、備件保稅庫200多家。
北京海關每年要完成30余萬份報關單的統計任務，統計內容包括進出口貨物、品種、商量、價值、國別等項目。近年來統計工作制度進一步科學化，實行了計算機檢控，統計數據質量達到較高水平，同時，還定期向市政府及其它部門提供統計數據資料和統計分析報告，為宏觀決策服務。
北京海關不斷加大打擊走私工作力度，逐步實現緝私裝備現代化、緝私手段科學化、緝私力量智能化。針對關區查私特點，積極有效地開展打私專項斗爭，成效明顯，查獲走私千萬元以上大案的數量逐年增加，年罰沒收入達8000萬元以上，沉重打擊了走私犯罪行為。
北京海關堅持從嚴治關，狠抓隊伍建設，加強廉政建設，實行干部交流制度和公務回避制度，強化競爭激勵機制，大力推進人事制度改革。不斷改進態度作風，優化作業程序，積極開展創建"文明窗口"活動，大力推進精神文明建設。先后有多個單位獲得各級機關的表彰和嘉獎。
