近代中國海關人事制度的主要特點是：洋人居統治地位以及海關監督和外籍稅務司之間的畸形關系。蒙自關（昆明關）歷任稅務司、代理稅務司共33人，其中外國人有32人。各海關的其他重要職位，也基本上由洋員包攬。
中華人民共和國的建立，宣告了帝國主義在中國的特權徹底破產，結束了半殖民地海關的恥辱歷史。云南解放后，1950年3月，對昆明關實行了軍事接管。建立了中國共產黨和人民政府對海關的領導。1951年，昆明關、騰沖關合并，稱昆明關。1953年，省對外貿易管理局并入昆明關，稱為“關局合并”。1956年，昆明關管理的對外貿易工作，劃回云南省對外貿易局，昆明關改由外貿部和云南省雙重領導。1961年，昆明關下放云南省領導，歸口省對外貿易局。1980年，改革海關管理體制，昆明關升格為局級關，直屬海關總署，實行垂直領導體制，改名為中華人民共和國昆明海關。
中華人民共和國海關是國家的進出境監督管理機關。其基本任務是，依照《中華人民共和國海關法》和其他有關法律、法規，監管進出境的運輸工具、貨物、行李物品、郵遞物品和其他物品，征收關稅和其他稅費，查緝走私，并編制海關統計和辦理其他海關業務。到2001年底，云南省有11個國家一級口岸，9個國家二級口岸及若干條通道。昆明海關設14個局處室，下設25個基層海關和辦事處，這些基層海關和辦事處分布在中緬、中越、中老邊境，以及一些進出口業務相對集中的內陸地州。
進入新世紀以來，昆明海關堅持“依法行政，為國把關，服務經濟，促進發展”的海關工作新方針，以“加強隊伍建設，深化通關制度改革”為工作中心，從嚴治關。在進一步加強隊伍建設和廉政建設的同時，順利完成了通關制度改革和機構改革，并采取有效措施，加強貨運監管、物流監控，強化稅收工作，嚴厲打擊各種走私違法犯罪活動，積極為云南省的對外貿易健康發展提供一個良好的環境。
