洛陽海關最早設立于1942年1月1日，當時名稱為"洛陽關"。太平洋戰爭爆發后，日本占領上海租界，中國海關總稅務司署不能在上海存在下去，國民黨政府財政部在重慶重新建立起海關總稅務司署，并且決定在未淪陷區內原未設有海關機構的地方設立海關。洛陽關就是在這時和西安關、蘭州關、上饒關、曲江關同時建立的，洛陽關當時設在洛陽東華街2號，稅務司為李桐華，副稅務司為周寶蔭，下設界首、南陽、鎮平、漯河、郟縣、禹縣等6個直關和關林、車站、郵局三個直所，內設會計、秘書、監察、總務、驗估等5科，總人數在200人左右。抗戰后期，戰局緊張，洛陽關曾于1944年3月向西撤到西安，抗戰勝利后于1946年5月正式撤消。
新中國成立后，特別是十一屆三中全會以后，隨著我國改革開放的不斷擴大，洛陽、三門峽等內陸地區的對外經濟迅速發展，特別是洛陽，大工業集中，科研單位集中，利用外資項目集中，三資企業已多達300多家，并且有著十分豐富的旅游資源，礦藏物產資源，還有著國家級高新技術開發區。為適應豫西地區經濟發展和對外開放的形勢，國務院于1992年8月批準在洛陽設立海關。1993年1月1日，洛陽海關籌備組成立，原鄭州海關貨管處處長常開建任籌備組組長，邊籌建邊開展業務。1993年2月4日開始承擔洛陽航空口岸旅檢業務，6月開始承擔洛陽關區進出口貨物查驗工作。1994年10月承擔國家重點工程小浪底水利樞紐工程施工設備材料監管業務。1995年10月12日正式開關，隸屬鄭州海關。關址設在澗西區周山東路，占地面積11332平方米，建筑面積11506平方米。
洛陽海關內設辦公室、綜合業務科、監管科、調查科和加工貿易監管科。主要業務有：接受進出口貨物、物品的報關，并實施查驗，征收關稅和進口環節稅；各種進出口貨物的減免稅審批及后續管理；加工貿易、易貨貿易的登記備案和后續管理；對各類與進出口活動有關的企事業單位進行海關注冊登記包括外商投資企業、外國常駐機構的登記備案和管理；負責關區里的報關員培訓；對保稅工廠、保稅倉庫、海關監管倉庫進行審批及管理；對企業進行海關信譽等級評估，實施分類管理；對各類與進出口活動有關的企事業單位進行海關稽查；對寄售代銷、維修服務、租賃業務進行審批管理；辦理境外捐贈有關手續；監管進出境運輸工具；監管免稅商店的進口貨物和進出境產品、技術交流物品及展覽品；查處各種走私、違規行為；編制海關統計和辦理其他海關業務。
洛陽海關全面貫徹“依法行政、為國把關”的工作方針，狠抓隊伍建設和業務基礎建設，深入扎實地開展了以“公正、廉潔、文明、高效”為目標的創建“海關文明窗口”活動，在關員中大力推行文明服務用語，規范并公開了各業務環節的辦事程序和辦事時限，實行服務承諾制，不斷提高工作質量。在業務工作中，把支持、服務小浪底工程作為工作重點和中心，對工程采取了人員、時間、交通工具、政策和技術等方面的“五保證”措施；采取上門服務、特事特辦、查驗貨物不過夜等措施，全力支持國有大中型企業外向型經濟發展。調整了旅檢現場布局和作業流程，使旅檢工作逐步向國際慣例靠攏，有力地促進了洛陽及整個豫西地區對外經濟貿易和科技文化的交往。
