鹽田港保稅區于1996年9月經國務院批準設立，位于鹽田港區中部，首期開發0.85平方公里，其中南片區0.71公里，北片區0.68平方公里，南片區與鹽田港的作業區相連；北片區位于鹽田港大道以北，緊臨鹽田港，南、北兩片以全封閉專用高架橋連接。1999年1月8日南片區經海關總署封關驗收合格，開始運作。
鹽田港保稅區作為特區中的特區，享受一系列比現行特區更加特殊的政策，鹽田港保稅區是全國15個保稅區中
少數與港口、鐵路、公路地域相連的保稅區，鹽田港國際航線覆蓋世界主要港口，目前已擁有十三條美洲線、四條歐洲線，一條亞洲線，一條澳洲線，集裝箱吞吐量已位于全國第二，1999年集裝箱吞吐量達158.9萬標準箱，而鹽田港保稅區與港口有直接的貨物通道，這就給物流的暢通提供了無可比擬的地緣優勢。鹽田港保稅區充分發揮地緣優勢、政策優勢和港口優勢，以港口為依托，物流為基礎，重點發展轉口貿易和倉儲業，相應發展港口工業，保稅生產資料市場，商品展示、商貿、金融、保險等業務。鹽田港保稅區按照滾動發展，分步實施的原則，進行開發建設。目前，已有香港、臺灣、美國等地區和國家到保稅區來投資，倉儲面積達到4萬多平方米。
